常使用的有：4℃、-20℃、-80℃冰箱。4℃适合储存某些溶液、试剂、药品等。-20℃适用于某些试剂、药品、酶、血清、配好的***和DNA、蛋白质样品等。-80℃适合某些长期低温保存的样品、大肠杆菌菌种、纯化的样品、特殊的低温处理消化液等的保存。0-10℃的层析冷柜适合低温条件下的电泳、层析、透析等实验。
2. 培养箱：37℃恒温箱用于**的平板培养及分子生物学实验。
3. 恒温培养摇床：用于大肠杆菌等生物工程菌种的扩增。
4. 水浴锅：用于保温并进行各类实验。
25-100℃水浴摇床可用于分子杂交试验，各种生物化学酶反应等试验的保温。
含低温的水浴槽可以用于分子生物学的质粒与基因片段的连接等实验及用于42度的大肠杆菌感受态的热激。
5. 烘箱：主用于烘干实验器皿，有些需要温度高些，有些需要温度低些。用于RNA方面的实验用具，需要在250℃烤箱中烘干，有些塑料用具只能在42-45℃的烤箱中进行烘干。
6. 超纯水机：随着分子生物学的飞速发展，许多实验对水纯度的要求越来越高，用自来水、蒸馏水、离子交换水、反渗透纯水做为供水，磁铁耦合齿轮泵作用使水循环。用于PCR、PCR氨基酸分析、DNA测序、酶反应、组织和细胞培养等。
7. 蒸汽**锅：分子生物学所用大部分试剂，而且实验用具都应严格****。用于小批量物品的随时**。大批实验物品、试剂、培养基可使用大型**且定时进行**。
8. 滤器滤膜：不耐高温、高压的试剂用其处菌。
9.各种天平：台秤、精密电子分析天平，用于称量各类试剂。
10.液体体积的度量：量筒、移液管、微量取液器、刻度试管、烧杯、锥形瓶等。
11.pH计：测定溶液中H+的直接电位的仪器，主要通过一对电极，在不同的pH溶液中产生不同的电动势用pH值表示出来；pH试纸：只适用于培养液、酚饱和液、缓冲液或其它试剂溶液的pH值的粗略估计。而大部分试剂的配制要求严格的pH值，需度高（小数点后两位）的pH计。
12. 分光光度计：光密度、分光光度计是利用物质在可见光和紫外线区域中的吸收光谱来鉴定该物质的性质及其含量的一种仪器。它是由光源、单色器、吸收池、接收器、测量仪表或显示屏幕所组成。OD值是许多溶液中溶质定量的方便指标之一，通过所产生的单色光而测定某一溶液对该单色光的吸收值，利用它可进行核酸溶液定量和纯度的初步判断。OD值也可以作为菌浓的检测指标。
13. 高速离心机：大转速25000 r/m ，大离心力89000g。有冷冻和常温两种，多用于制备和手收集微生物、细胞碎片、细胞、大的细胞器、硫酸铵沉淀物以及**沉淀物等。
14.超净工作台：内有紫外灯、照明灯、还应有酒精灯火焰、75%乙醇等**的设备，是一种局部洁净度的设备。其原理是鼓风机驱动空气，经过低、中效的过滤器后，通过工作台面，使实验操作区域成为无菌的环境。
15.电泳系统：电泳技术是检测、鉴定各种生物大分子的纯度、含量及描述它们的特征，甚至还是分离、纯化、回收和浓缩样品的工具之一。
电泳系统分为电源和电泳槽，电源需经稳流通过稳压器，既能稳定的直流电，又能输出稳定的电压；水平式电泳槽：一般分为微型电泳槽和大号水平式电泳槽
16.PCR仪：Polymerase Chain Reaction仪，也称DNA热循环仪，基因扩增仪，它是使一对寡核苷酸引物结合到正负DNA链上的靶序列两侧，从而酶促合成拷贝数百万倍的靶序列DNA片段，它的每一循环包括在三种不同温度进行的DNA变性，引物复性，DNA聚合酶催化的延伸反应三个过程。需要说明的是，有些实验室可能还需要梯度PCR仪或实事定量荧光PCR仪来进行一些特殊的分子生物学实验。
17.
凝胶成像分析系统：不用紫外和EB、操作**、直接读取数据。